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Biochimie Cheat Sheet (DRAFT) by

A French cheatsheet for Bioche.

This is a draft cheat sheet. It is a work in progress and is not finished yet.
 

Lois et Grandeurs

Taille d'un atome
10-11
Taille d'un nucléon
10-15
Angstrom
10-8cm
Intera­ction Nucléaire Forte
100 - 10-15m
Intera­ction Electr­oma­gne­tique
10-2 - infinie
Intera­ction Gravit­ati­onnelle
10-38 - infinie
Intera­ction nucléaire faible
10-7 - 10-18m
Masse e-
10-27g
Qté de matière n(en mol)
n = m/M
n = C * V
Règle duet-octet
Atomes sont au plus stable lorsqu'ils possèdent 8 e- dans leur couche de valence. La 1ere couche n'en possède que 2.
Loi d'action de masse
Le taux de réaction est propor­tionnel à la concen­tration des substances reactives.

Liaisons et Réactions

Liaison Hydrogène
Hδ+ d'une molécule est attiré par un atomeδ- d'une autre molécule
12-30k­J/mol
0.3nm
Intera­ction de Van der Waals
Intera­ction électrique temporaire et de faible densité entre deux atomes­/mo­léc­ules.
0.4-4.0­kJ/mol
0.3-0.6nm
Liaison Ionique
Un atome plus chargé qu'un autre arrive à lui arracher un e-, formant une liaison ionique.
20kJ/mol
0.25nm
Intera­ction Hydrop­hobique
Tendance des molécules non-po­laire à s'agregér au sein d'une solution aqueuse et à exclure les molécules d'eau
<40kJ/mol
Liaison Covalente
Liaison forte formée par deux atomes lors d'un partage d'e- entre couches de valence. Simple, double, triple... Polaire si inégale répart­ition de la charge entre atomes lié.
Liaison Peptidique
Formée par réaction de déshyd­rat­ation entre deux AA. Fusion amine-­car­boxyle, formation d'un dipeptide + H20
Liaison Glycos­idique
Lie un monosa­cch­aride avec une autre molécule pas forcément sucre.
Liaison Phosph­odi­ester
Lie un groupement phosphate à deux autres molécules via deux liens ester.
 

Macrom­olé­cules

Acide Aminé
Monomère qui composent les protéines. 20+2 AA différ­ents. Tous possèdent une structure similaire, seul le radical change. C'est lui qui détermine la nature chimique de l'AA(acide ou base, polari­té...)
Protéines
Polype­ptides, chaîne d'AA lié entre eux par liaisons peptid­iqu­es(­enz­ymes, hormon­es...). La forme d'une protéine est critique pour sa fonction.
Niveaux d'orga­nis­ations:
1. Résulte de la combin­aison unique d'AA dans la chaine polype­pti­dique
2. La chaîne polype­tidique est pliée en certains points donnant lieu à une structure second­aire. Les deux pliages les plus courant sont l'𝛂-helix et le 𝞫-pleated sheet.
3. Structure en 3Dimen­sions du polypetide qui emerge de l'inte­raction entre les differents radicaux de la chaine peptid­ique, Liaisons ioniques, Intera­ction hydrop­hobique ou Disulfide linkage.
4. Résulte de l'inte­raction entre differ­entes chaines peptid­iques d'une meme proteine. Intera­ction faible qui stabil­isent la structure generale.
Enzyme­(-ase)
Protéine catalyse les réactions chimiques sans être altérées par celles-ci. Fixation spécifique subtra­t-site actif. Site actif contient des AA qui aident à la fixation et réduisent Eactiv­ation nécessaire à la réaction.
Hormone
Protéine secrétée par cellule endocr­ynes. Fonction signal­ement chimique et régulateur de processus physio­logique spé.
Lipide
Macro-­mol­écules majori­tai­rement non-po­lai­re(­hyd­rop­hobe) car constitué d'hydr­oca­rbure lié par liaison non-po­laire.
Acide Gras ou AG
Acide Carbox­ylique à chaîne alipha­tique. Saturé possède uniquement liaisons simples.
(Poly)­Ins­aturé présence de doubles liaisons, cis(to­rsion, non-en­tas­sem­ent­)-fat.
Trygli­céride ou Molécule de Gras
Glycérol + 3 AG.
Phosph­olipide
Amphip­atique, composant membrane plasmique.
Dyglic­éride = Glycérol + 2 AG + Grp Ph modifié
Stéroide
Quatre anneaux de carbone fusionné comme Choles­terol.
Carboh­ydrate
Composé de (CH20)n ou n est le nbr de C dans molécu­le(­1:2:1).
Monosa­cch­arides
Sucre simple­(mo­nomere) comme le glucose. Chaine lineaire ou forme d'anneau.
3-7C -ose Aldehy­de-­Aldose Ketone­-Ketose
Polysa­cch­arides
Chaine de monosa­cch­arides lié par liaisons glucos­iques lors d'une hydrolise. Amidon, Glucogène, Cellul­ose...
Nucléotide
Grp Ph + Sucre Pentose + Base azotée.
ADN→Adenine, guanine, cytosine, thymine.
ARN→Adenine, guanine, cytosine, uracile
Acide Nucléique
Chaîne de nucléotide liés entre eux par liaison phosph­odi­ester C 3'-5'.
ARN
Plusieurs formes­(RNAm, RNAt, microR­NA...). Single­-st­randed. Rybose, moins stable mais possib­ilité de structure complexes.
ADN
Double­-hélice liaison hydrogène entre paire (3 pour CG, 2 pour TA). Sucre déoxyr­ibose. Polarité induite par liaisons phosph­odi­ester. Anti-p­ara­llé­lis­me(­5'-3'). Right-­handed twist.
 

AA

Polysa­cch­arides

Nucléotide

ADN